8月5日，长航局副局长阮瑞文带队，对黄旗滚装码头奥运安保工作进行了现场检查，针对发现的问题，提出四个方面整改意见：一是内部安保人员力量薄弱，安检责任有待落实；二是企业对奥运安保工作重要性认识不够，各项管理制度必须进一步落实；三是企业的安全监管责任主体必须落实到位；四是企业要开展安全隐患排查治理活动，查盲区，找漏洞，加大隐患整改力度。
　　该公司接到整改意见后，高度重视，召开中层干部紧急会议，并连夜组织人力物力投入整改。
　　8月7日，港航、公安、海事组成的联合检查验收组到黄旗滚装码头现场进行了整改情况复查：
　　（一）落实了安保、安检人员。在原有基础上增加了安保人员3名、安检人员3员。
　　（二）较好地完成了周界隔离。到7日05：00时，用铁丝网完成周界隔离2100米、彩旗标示1100米，明确了滚装车较为封闭的专用通道。
　　（三）完善了功能区域设置。设立了待检区、第一次安检区站、第二次安检区站、码头前沿爆炸物品应急处置区、紧急疏散区、滚装车进出港门道，并用活动式板房和岗亭替换原有的工棚式安检点。
　　（四）完善了相关标识、标牌。增加了奥运安保宣传标语和区域服务标识，以及车辆、人员、安保须知、作业流程等相关告示牌。
　　（五）明确了企业安保工作的主体责任。视频监控系统由公司接管，指定专人24小时值守；车辆登记、检查工作进一步加强；区域范围巡查工作与长航公安的分工明确。
　　（六）实行滚装、施工车辆和司乘人员通行证制度，凡是进港车辆必须接受武装检查。